macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-08-10から1日間の記事一覧

大規模なメタゲノムのシミュレータ CAMISIM

2019 3/8 タイトル修正 図追加 16q rRNAアンプリコンとショットガンメタゲノムシーケンシングは、健康や病気に関するヒトマイクロバイオーム研究に広範に使われている[prepirntより ref.1, 2] 。私たちはその後、天然に存在する微生物群集は、生物多様性の広…

ターゲットキャプチャシーケンシングをシミュレートする capsim

高スループットシークエンシング(HTS)は、費用対効果が高く時間効率の良いサンプルの完全な遺伝情報を得る能力を持ち、ゲノム研究に大きく革命をもたらした。多くの臨床応用において、作用可能な領域のパネルのみが調査対象である(Bellos et al、2014; Sa…