macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-05-12から1日間の記事一覧

ショートリードとロングリードのハイブリッドエラーコレクションツール Jabba

2019 7/26 追記 生物のDNA配列の正確な決定、すなわち、DNA分子中のヌクレオチドA、C、GおよびTの正確な順序を確立することは、生物学における基本的かつ挑戦的な問題である。本質的にこのプロセスは2つのステップから成っている:(1)ケミカルプロセスによ…

k-tuplesに基づきビニング結果を改善する d2SBin

メタゲノミクスシーケンシングは、微生物群集の深い洞察を提供する[論文より ref.1]。メタゲノミクスデータ内の分類学的構造を調べるための重要なステップは、アセンブリされたコンティグをビン(bins)と呼ばれる別個のクラスターに割り当てることである[re…