macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-05-02から1日間の記事一覧

RNA-seqのクロスコンタミを検出する Croco

核酸試料間の汚染は、分子生物学における潜在的な問題として長く認識されてきた。ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)による増幅や、そして最近ではハイスループット配列決定でのPCR増幅は、ソースにかかわらず、また非常に低レベルの混入した核酸でさえ、十分な範…

ONTのアーティファクトを取り除く CarrierSeq

環境メタゲノムシーケンシングは、多くの課題を提起する。第一に、複雑な土壌マトリックスと強靭な生物は、デオキシリボ核酸(DNA)とリボ核酸(RNA)の抽出を妨げる[論文より ref.1]。第2に、低バイオマス試料は、汚染の可能性も高める、さらなる抽出および…