macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-05-01から1日間の記事一覧

ロングリードのシミュレーター SiLiCO

広範に使用されているPacBioプラットフォームおよびOxford Nanoporeプラットフォームを含む長いリード配列決定プラットフォームは、15〜20キロベースを超える配列断片を生成することを目的としており、構造変異の同定およびゲノムアセンブリを容易化する 。 …

K-mer分析ツールキット KAT

ハイスループットの全ゲノムショットガン(WGS)データセットの迅速な解析は、大きなサイズが生み出す複雑さのためにチャレンジングである(Schatz et al、2012)。 WGSデータを分析するためのリファレンスが不要なアプローチは、基本的な品質、リード長、GC…