macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-04-30から1日間の記事一覧

k-merを使ったリードフィルタリングを行う Cookiecutter

次世代シークエンシング技術は、より安価になり、ルーティンの分析に役立っている。アセンブリの前に未処理のリードから特定のシーケンスを抽出または削除することを必要とする多くのタスクがある。抽出された領域特異的なリード(例えば、mtDNAまたはrRNAか…

ロングリードのクオリティ分析とトリミングを行う Filtlong

FiltlongはONTのロングリードのクオリティ分析やクオリティ、リード長のトリミングが行えるツール。ウルトラロングリードを低クオリティ領域でカットして、分割出力する機能も備える。2018年4月現在Githubで公開されている。 インストール mac os10.13に導入…