macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-04-20から1日間の記事一覧

samやfastqの単純分割

リードの境目を気にせず、とにかくfastqやsamを分割したいという時は、splitコマンドが使いやすい。 --非圧縮ファイルの分割-- 100Mbずつ分割し、gzip圧縮して保存。 split -b 100m input output_ && gzip output_* 非圧縮出力で良いなら、&&の手前まででOK…