macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-03-26から1日間の記事一覧

VCFのユーティリティツール VCF-kit

2019 7/29 condaインストール追記 集団および量的遺伝学は、集団内の個体がどのように異なるかを調べる。これらの違いを特定することにより、様々な分析を行うことができる。例えば、遺伝子変異は、表現型の基礎を特定し、進化論的な質問に答えるために、ま…

VCF / BCFの高速なパーサ cyvcf2

2019 7/27 condaインストール追記 VCF形式(論文より Danecek et al、2011)は、DNAシーケンスの研究で観察された遺伝的変異を表すためのスタンダードである。 VCF形式の強みは、変異の位置、各遺伝子座におけるシーケンスされた個体の遺伝子型、ならびに広…