macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-02-19から1日間の記事一覧

de novo transcriptome assemblyの適切なk-merレンジを推定する KREATION

de Bruijn graphを使ったde novoトランスクリプトームのアセンブルでは、単一のk- merより異なるk merのアセンブル結果を統合した方が感度が増す。KREATIONは関連するアセンブリの比較クラスタリングを使用して、追加のkmerアセンブリの重要性を推定するツー…