macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-02-14から1日間の記事一覧

NGSのリード情報を使いスキャッホールドのギャップを埋める FGAP

FGAPはドラフトゲノムのギャップを埋めるためのツール。BLASTを使用して、複数のコンティグをドラフトゲノムアセンブリに対して整列させ、ギャップを埋めるために最良のシーケンスを検出する。ヒトchr14では、ギャップの数を35%減少させたと述べられている…