macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-01-25から1日間の記事一覧

de novo transcriptome assembliesを評価する rnaQUAST

rnaQUASTはde novo transcriptomeのアセンブルパフォーマンスを比較するツール。リファレンスゲノムやtranscriptsのカタログにアセンブルした配列をアライメントし、様々な統計データをPDFで出力する。リファンレンスの遺伝子情報(gtf)がない時でも、ラン…