macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-01-19から1日間の記事一覧

様々なバイオインフォマティクスツールの分析結果を1つに集約して分析できる MultiQC

2019 1/16 誤字修正および対応ツール情報更新 今まで様々なNGSの評価ツールが発表されてきたが、それらは特定のデータを評価するものであり、プロジェクト全体で品質評価(クオリティチェック)するためのツールがなかった。プロジェクト全体で一貫した品質…

Feature response courveによりアセンブルを評価するFRC_align

アセンブルのパフォーマンスを表す指標として N50やコンティグの数などがよく用いられているが、アセンブルの精度はこの値には反映されていない。FRC_alignは、Feature response courve: FRC(FRCを使ったアセンブル評価)を計算出力することで、異なるツー…

DNAでもRNAでも使える、複数サンプルのマッピングを同時比較できるGUIツール Qualimap2

2019 9/8 インストール追記 公式サイト http://qualimap.bioinfo.cipf.es ユーザーマニュアル http://qualimap.bioinfo.cipf.es/doc_html/index.html ワークフロー http://qualimap.bioinfo.cipf.es/doc_html/workflow.html CUI環境でのラン。 http://qualim…