macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-12-23から1日間の記事一覧

ABySS 2.0アセンブラ

2022/12/27更新 ABySS1.0はヒトゲノムのアセンブルも可能であったが、SOAPdenovoなどと同様600GB以上のメモリを必要とするなどコンピュータ負荷が高い問題があった。AByss2.0は一桁以上メモリ要求量を減らし、より効率的にアセンブルが行えるように工夫され…