macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-11-30から1日間の記事一覧

メタゲノムデータからホストゲノムなどのコンタミを除く作業を自動化するラッパーツール KneadData

バクテリアのメタゲノム解析では、度々ホストゲノムのコンタミリードがシーケンスされてしまうことがある。KneadDataはそのようなホスト由来のリードや低クオリティのリードをフィルタリングするために設計されたツールである。 Trimmomaticでのクオリティト…