macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-10-06から1日間の記事一覧

ナノポアのロングリードを使うとアセンブルはどのくらい改善されるのか?

ハイクオリティなショートリードのデータに、ロングリード情報を混ぜ込むとどれくらいアセンブリは改善されるのか調べてみる。 NがあってもgrepやUCSC ゲノムブラウザで除くことができるが、それでは肝心の繰り返し領域の評価が曖昧になる。やはりNがないコ…

Minionでシーケンスを行う

Minion(ミナイオン)でシーケンスする流れを説明する。 ナノポアに関しては模索中の段階です。書いていることが必ずしも正しいとは限らないことに注意してください。 追記 動画マニュアルリンク削除 & HTMLマニュアルについて追記 公式のリンクをいくつか貼…