macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-09-16から1日間の記事一覧

VCFを管理、編集する VCFtools

2019 4/16 condaインストール 2019 12/9ビルド手順の誤り修正 2020 1/5 mergeの説明追加 2020 4/18 基本コマンド追記 VCFtoolsは、バリアントコールフォーマットのVCFファイルのマージ、ソートやフィルタリング、固有変異の抽出などができるツール。 よく使…

マルチプルアライメンントのトリミングツール trimAI

2020 5/14 help追記 マルチプルアライメントを行うとアライメントがほとんどできない領域ができることがあるが、そういった領域は情報として利用するのが難しいため、一般的に除去しても問題にならない。trimAIはラージスケールにも対応したマルチプルアライ…