macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-09-13から1日間の記事一覧

リファレンスを変えて、変異株のゲノム配列を作る。

2019 8/3 リンク追加 変異のコール結果であるVCFファイルを元に変異株のゲノムを作りたいことが時々ある。そうゆう時は、gatkのFastaAlternateReferenceMakerが利用できる。 マニュアル gatkがない人はbrewで導入しておく。 brew install gatk 実行方法 入力…