macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-09-11から1日間の記事一覧

メタゲノムcontigのカバレッジ、GC、taxonomy情報を可視化して分析できる BlobTools

2019 1/16 テストラン追加、diamondデータベースbuidコマンドエラー修正 2019 1/19 diamondデータベースbuidコマンド修正 2019 1/21 追記 2019 6/22 インストール追記 アセンブリしたcontig中に、アセンブリツールのアーティファクトやコンタミ由来のcontig…

アセンブルのgraphを可視化する GUIツール Bandage

2018 9/19 コマンド修正 2018 11/17 文章修正 2018 12/15 インストール追記 2019 2/28 追記 2019 3/19 scafofldsのコマンドのミス修正 2019 5/15リンク追加 bandageはde novo assemblerのfastgファイルを入力として、graphパスを描画してくれるツール。て201…