macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-09-02から1日間の記事一覧

メタゲノムデータをbinningして出力可能なGUIアプリ VizBin

VizBinはメタゲノムデータをレファレンスに依存せずにbinnigする手法。5-merの配列 をオリゴヌクレオチドの頻度として計算し、其の頻度からアセンブルデータを分類する。最終的に2次元のPCAプロットとしてビジュアル化してくれる。どこからどこまでを1つの…