macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-08-29から1日間の記事一覧

多機能なNGS分析ツール BBtools 其の2

20196/13 タイトル修正 2020 7/24 bbdukコマンド追記 の続き。BBtoolsの残りのコマンドを紹介する。紹介するのは以下のコマンド。 Reformat - フォーマット変換やクオリティトリミング。 Repair - ペアリードの順番が壊れたファイルを修復する。 Stats - ア…

多機能なNGS分析ツール BBtools 其の1

2018 9/5 bbmerge-auto.sh修正 2019 5/14 BBnormコメント修正、パラメータ修正、ヘルプ追加 2019 6/13 タイトル修正 2019 6/19 其の3追記 2020 1/29 condaインストール追記、メモリ使用量指定 BBtoolsはアメリカのJGIが提供している多機能なNGS向けの解析ツ…