macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-08-19から1日間の記事一覧

変異のフィルタリングを行うSnpSift

以前SnpEffという変異のアノテーションを行うことができるツールを紹介した(リンク)。このツールにはもう一つSnpSiftというツールが同梱されている。SnpSiftは変異コール結果のVCFファイルを扱うツールで、クオリティやp値など様々な指標に基づいて変異を…