Biostarとbedtoolsの公式サイトに、bedtoolsを使ったpromoter配列の抽出の仕方がまとめられている（How To Use Bedtools To Extract Promoters From A Mouse Bed File）。試してみる。 このようなbedファイルの各featureの上流を抽出する。 user$ head -5 ge…

勉強会用資料 時系列データ publishされた論文 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1631069115000888?via=ihub 利用するシーケンスデータ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=SRP032854 fastaとgtf http://plants.ensembl.org/…