macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-06-18から1日間の記事一覧

Prokaryotesのアノテーションツール Prokka

2018 10/6 タイトル修正 2019 4/3 説明修正 2019 4/12 dockerリンク追加 2019 5/27 インストール方法追加 2019 7/6 dockerリンク修正 2019 7/6 コマンド修正、help追加、タイトル修正 Prokkaは、バクテリア、アーキア、ウィルスのアノテーションツール。はじ…

Oxford Nanoporeリードのアセンブリ MiniasmとNanopolish

2019 4/4 ヘルプ追記 2019 6/21 文章修正 2019 7/17 コメント追加 MiniasmはPacbioのロングリードやナノポアのロングリードのアセンブルツールで2015年に論文が発表された (ref.1)。アルゴリズムはオーバーラップ法になる。アセンブル時間が非常に短いのが特…