macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-06-17から1日間の記事一覧

Pacbioロングリードのシミュレーター PBSIM

2019 7/28 condaインストール追記 PBSIMはPacbioリードのシミュレーションを行うツール。ユーザーの持っているPacbioデータをもとにリードの長さやクオリティをシミュレートすることもできるため、実際の解析に適用しやすい。 インストール GitHub - pfaucon…

contigからScaffoldを作るツール

contigからScaffoldを作るツールがいくつか発表されているので試してみる。 SSPACE-LONGREAD ダウンロードリンク https://www.baseclear.com/genomics/bioinformatics/basetools/SSPACE-longread ダウンロードには上記リンクから名前や所属の入力が必要。登…