macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-06-16から1日間の記事一覧

Oxford nanoporeやpacbioのロングリードのアセンブリツール canu

2018 10/23 追記 2019 1/16 追記5 2019 3/16 bioconda追記6、canu -hヘルプ追記 2019 3/18 追記7 2019 4/12 追記8 dcokerリンク追加 2019 5/14 追記8リンク追加 1分子ロングリードシークエンシングはデノボゲノムアセンブリに革命をもたらし、参照品質ゲノム…

ナノポアリードの分析ツール

2017年現在、すでにOXford nanoporeの分析ツールは色々発表されている。いくつかインストールとして実際に使ってみた結果を紹介する。 NanoOK インストール マニュアルページ https://documentation.tgac.ac.uk/display/NANOOK/NanoOK+tutorial 本体以外に必…