macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-06-15から1日間の記事一覧

ゲノムの相同性の高い領域の網羅的な検索 LAST

2019 6/9 biocondaインストール追記 ゲノム配列のアラインメントは多くの研究の基礎を成している。ゲノムアラインメントは、さまざまな日常的ではあるが重要な選択、たとえばリピートをマスクする方法や使用するスコアパラメータに依存する。驚くべきことに…

Oxford Nanoporeリードのマッピング

7/10 LAST コマンドミス修正 bwa memとLASTがナノポア向けにチューニングされたとナノポア公式ページでアナウンスされている。 https://nanoporetech.com/publications/bwa-and-last-have-been-tuned-work-nanopore-reads bwa memはショートリード時代から1M…