macでインフォマティクス

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NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-03-30から1日間の記事一覧

RNA seq 非モデル生物の解析

ゲノム情報がない場合、まず最初にアセンブリから始めることになる。RNAのアセンブリはTrinityが有名なのでtrinityを使ってみる。練習データとして、SRAに登録されているレタスのRNA seqデータを使う。 http://trace.ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/submission?ac…